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146368-16-3|Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
产品描述：
Cyanine3（Cy3），是花青素荧光素染料家族的成员之一，是化学合成的聚甲炔染料。目前Cyanine系列染料以两种异构体的形式供货，一种是非磺化花青素（non-sulfonated cyanines），一种是磺化花青素（sulfonatedcyanine）。两者的光谱性质几乎*，因此大部分应用可相互替换，比如，都可用于标记DNA或蛋白等生物分子。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。
本Cy3 NHS ester，即含N-羟基琥珀酰亚胺（N-Hydroxysuccinimide）活化基团的Cy3，可直接与生化分子上的氨基（-NH2）反应形成稳定的酰胺键，主要是伯胺。

  146368-16-3|Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
一般特性：
外观:

red powder
质谱分析M+增量:

474.2
分子量:

590.15
分子式:

C34H40ClN3O4
溶解性:

soluble in organic solvents (DMF, DMSO, dichloromethane), insoluble in water
质量控制:

NMR 1H and HPLC-MS (95%)
储存条件:

Storage: 24 months after receival at -20°C in the dark. Transportation: at room temperature for up to 3 weeks. Avoid prolonged exposure to light. Desiccate.
光谱特性：
 zui大激发波长, nm:

555
在zui大激发波长下的消光系数, Lmol-1cm-1:

150000
zui大发生波长, nm:

570
荧光量子产率:

0.31
运输和保存方法：
冰袋运输。-20℃干燥避光保存，有效期1年。
注意事项
1）NHS ester基团对湿度非常敏感，务必干燥保存产品。使用前产品需放到室温回温至少20min。
2）NHS ester基团的水解发生在水溶性缓冲体系属于竞争性反应。对蛋白/多肽（浓度：1-1mg/ml）伯胺的连接反应建议在pH 7-9范围内进行。使用不含氨基的缓冲体系，pH 7-9。比如100 mM 磷酸钠，150 mM 氯化钠， pH7.5； 100mM Hepes, pH 7.5。100 mM 碳酸钠/碳酸氢钠, pH 8-9；或100mM硼酸缓冲液, pH 8-9。
3）不要使用含伯胺的任何缓冲液，比如Tris，甘氨酸。
4）为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。
使用方法：（用Cy3-NHSEster 标记抗体）
【注意】：可参考本方法进行多肽，蛋白或者其他分子的标记，需要根据具体的实验体系对合适的标记缓冲体系，样本浓度，染料浓度等参数做出合适的调整。
1）用不含氨基的合适的缓冲液（eg.100mM磷酸钠，150mM NaCl, pH7.5）溶解抗体使其浓度达到1-5mg/ml。【注】：如抗体中有残留Tris或 glycine 污染，则需透析或者脱盐到合适的缓冲液内。
2）使用前，用适量去离子水或者无水DMSO溶解Cy3-NHS，使其摩尔浓度为抗体摩尔浓度的400倍，例如，待标记的IgG浓度为1mg/ml（eg 6.7μM），则溶解后Cy3-NHS的浓度为2.7mM；如待标记的IgG浓度为2.5mg/ml，则溶解后Cy3-NHS的浓度为6.75mM；
3）向抗体中加入适量Cy3-NHS试剂，以达到预期的标记效率。【注】：当用Cy 3 NHS ester标记抗体或其他蛋白，亮度zui高的偶联物其染料/蛋白的比率为4-12，取决于特定的应用。过高比率会增加非特异性背景，丧失抗体特异性结合，导致聚集。建议根据应用优化标记比率。
4）室温孵育60min（或更长）；
5）利用合适缓冲液透析或脱盐柱去除未反应的试剂；
6）分别在280nm和550nm检测Cy3-抗体的吸光值；
7）测定Cy3标记效率（DOL）和标记浓度。见下公式。
公式一. 利用下面公式计算Cy3标记效率（DOL）及其浓度（mg/ml）
E.1  Number of Cy3 dye per protein=molarity Cy3  dye / molarity protein
E.2  [Molarity of Cy3 dye]=A555/ε555
E.3  [Molarity of protein]=A280C/ε280
E.4  mg/ml=[A280-(A555×0.08)/(E1%/10)]×dilution  factor
【注】上述参数如下：
A555=conjugate  absorbance at 555±2nm
ε555=molarextinction  coefficient Cys dye =150000M-1cm-1
A280=  conjugate absorbance at 280nm
A280C=corrected conjugate absorbance at 280nm= A280-( A555×0.08)
ε280= molarextinction  coefficient protein(M-1cm-1)=MWp×E1%/10
其它染料列表：
N-羟基琥珀酰亚胺脂Dye NHS esters
Pyrenebutyric acid NHS ester
ROX NHS ester, pure 6- isomer
BDP FL NHS ester
FAM NHS ester
Cyanine3 NHS ester
Cyanine3.5 NHS ester
Cyanine5 NHS ester
Cyanine5.5 NHS ester
Cyanine7 NHS ester
Cyanine7.5 NHS ester
Sulfo-Cyanine3 NHS ester
Sulfo-Cyanine5 NHS ester
sulfo-Cyanine5 bis-NHS ester
Sulfo-Cyanine7 NHS ester
马来酰亚胺 Dye maleimides
Pyrene maleimide
BDP FL maleimide
Cyanine3 maleimide
Cyanine5 maleimide
Cyanine5.5 maleimide
Cyanine7 maleimide
Cyanine7.5 maleimide
Sulfo-Cyanine3 maleimide
Sulfo-Cyanine5 maleimide
伯胺 Primary amine
BDP FL amine
Cyanine3 amine
Cyanine5 amine
Cyanine5.5 amine
Cyanine7 amine
Cyanine7.5 amine
Sulfo-Cyanine5 amine
Sulfo-Cyanine7 amine
酰肼 Dye hydrazides
Pyrene hydrazide
BDP FL hydrazide
Cyanine3 hydrazide
Cyanine5 Boc-hydrazide
Cyanine5 hydrazide
Cyanine5.5 hydrazide
Cyanine7 hydrazide
Cyanine7.5 hydrazide
马来酰亚胺 Dye maleimides
BDP FL maleimide
Cyanine3 maleimide
Cyanine5 maleimide
Cyanine5.5 maleimide
Cyanine7 maleimide
Cyanine7.5 maleimide
Sulfo-Cyanine3 maleimide
Sulfo-Cyanine5 maleimide
羧酸 Carboxylic acids
Pyrenebutyric acid
BDP FL carboxylic acid
Cyanine3 carboxylic acid
Cyanine3.5 carboxylic acid
Cyanine5 carboxylic acid
Cyanine5.5 carboxylic acid
Cyanine7 carboxylic acid
Cyanine7.5 carboxylic acid
Sulfo-Cyanine3 carboxylic acid
Sulfo-Cyanine5 carboxylic acid
Sulfo-Cyanine7 carboxylic acid
点击化学试剂
非荧光炔烃 Non-fluorescent alkynes
Pentynoic acid STP ester
Biotin alkyne
非荧光叠氮化物 Non-fluorescent azides
Azidobutyric acid NHS ester
Biotin azide
寡核苷酸分析
亚磷酰胺 Phosphoramidites
FAM Phosphoramidite, 6-Isomer
Alkyne Amidite, hydroxyprolinol
Alkyne Phosphoramidite, 5'-terminal
DMS(O)MT aminolink C6
Long trebler phosphoramidite
Pyrene phosphoramidite dU
PCR/PCR PCR/PCR
ROX reference dye for PCR
SYBR Green I Gel Staining Solution, 10000x
SYBR Green I for Real Time PCR, 100x
CPG固相修饰 CPG solid supports
Alkyne CPG modifier 500
TFA-Amino modifier CPG 500
三磷酸酯修饰 Modified triphosphates
Ami1-ddUTP
Ami1-dUTP